L'itinéraire en Ombrie commence à Città della Pieve, la ville natale du maître, où il est possible d’admirer l’Adoration des Mages à l'Oratoire de Santa Maria dei Bianchi (1504), dans la cathédrale, le Baptême du Christ et la Vierge à l'Enfant avec les saints Gervasius, Pierre Paul et Protasius, et la Déposition de Croix au Museo Civico Diocesano de Santa Maria dei Servi.
De Città della Pieve, nous nous rendons à Panicale, un petit bourg médiéval ; l’église de San Sebastiano abrite la fresque consacrée au Martyre du Saint (1505), nous rejoignons ensuite Fontignano, où l’église de l'Annunziata abrite sa dernière œuvre, la Madone trônant avec l'Enfant ; c’est dans cette même église que se trouve son tombeau ; nous continuons en direction de Corciano avec l’église de Santa Maria Assunta qui abrite un retable représentant la Vierge Assumée au Ciel. À Pérouse, la Galerie nationale de l'Ombrie expose diverses œuvres, dont l’Adoration des Mages, le gonfalon avec la Pietà et la Madone de la Consolation. Au Collegio del Cambio, le Divin Peintre a peint à fresque de la Sala delle Udienze où l'on peut admirer son autoportrait. Dans la chapelle de San Severo, vous pourrez admirer la fresque de la Trinité et des saints, commencée par Raphaël.
À Deruta, la Pinacoteca Comunale abrite la fresque de 1476 représentant l’Eterno benedicente tra i Santi Romano e Rocco avec une vue sur la ville. Une autre œuvre de la moyenne vallée du Tibre est la fresque représentant saint Sébastien et des fragments de saint Roch et de saint Pierre dans l'église de Santa Maria Assunta de Cerqueto.
Le musée de la ville de Bettona expose Saint Antoine de Padoue et le dévot (1512-1513), et la Vierge de la Miséricorde avec les saints Étienne et Jérôme. Le Pérugin était également présent dans la basilique de Santa Maria degli Angeli à Assise, sur le mur extérieur de la Portioncule, en 1486, il a peint une grande Crucifixion. Spello et Trevi conservent plusieurs de ses dernières œuvres datant de 1521 : la Pietà et la Madone trônant avec l'enfant et les saints, peintes sur les côtés de l'autel de la collégiale de Santa Maria Maggiore à Spello, et l’Adoration des Mages, les saints Pierre et Paul et l'Annonciation dans l'église de Santa Maria delle Lacrime à Trevi.
La fresque de la Nativité du complexe muséal de San Francesco à Montefalco date de 1503 et reprend le même sujet et la même composition que la peinture exécutée trois ans plus tôt au Collegio del Cambio. L'itinéraire se termine dans le centre historique de Foligno, à l’oratoire de la Nunziatella où est représenté le baptême du Christ avec l'Éternel en gloire entre deux anges.
